Το φορτίο στις περισσότερες μεταφορές με εμπορευματοκιβώτια είναι μεικτό. Περιλαμβάνει δηλαδή εμπορεύματα τόσο της Ένωσης, όσο και τρίτων χωρών, τα οποία διαμετακομίζονται σε τακτική βάση μέσω λιμένων εκτός Ε.Ε. (π.χ. της Βαλτικής, της Μεσογείου και του Εύξεινου Πόντου).
Το καθεστώς των "τακτικών γραμμών θαλάσσιων μεταφορών" δεν είναι δυνατό να εφαρμοσθεί σ' αυτές τις μεταφορές. Για το λόγο αυτό, θα καθιερωθεί ένα νέο εργαλείο, το "eManifest", ένα εναρμονισμένο ηλεκτρονικό δηλωτικό φορτίου που θα βασίζεται στα ισχύοντα έντυπα FAL.